膠原病は「皮膚・関節・腎・肺」の4臓器を中心に障害する疾患が多く、そこに各疾患特有の臓器障害（例：SLEの中枢神経、強皮症の食道、シェーグレンの外分泌腺、APSの血栓症）が加わると整理しやすくなります。
| 臓器 | 主な症状・所見 | 主な疾患 |
|---|---|---|
| 皮膚 | 蝶形紅斑、円板状皮疹、光線過敏 | SLE |
| 手指硬化、皮膚硬化 | 全身性強皮症 | |
| ヘリオトロープ疹、ゴットロン徴候、ショール徴候、V徴候 | 皮膚筋炎 | |
| 結節性紅斑 | ベーチェット病、サルコイドーシス | |
| 紫斑・皮膚潰瘍 | ANCA関連血管炎、APS | |
| 眼 | 乾燥性角結膜炎 | シェーグレン症候群 |
| ぶどう膜炎・虹彩毛様体炎 | ベーチェット病 | |
| 強膜炎・上強膜炎 | RA | |
| 口腔 | 口腔乾燥、う歯 | シェーグレン症候群 |
| 無痛性口腔アフタ | ベーチェット病 | |
| 関節 | 対称性多関節炎、朝のこわばり | 関節リウマチ |
| 非びらん性関節炎 | SLE | |
| 関節痛 | 多くの膠原病 | |
| 筋肉 | 近位筋筋力低下、CK上昇 | 多発性筋炎・皮膚筋炎 |
| 肺 | 間質性肺炎 | 強皮症、皮膚筋炎、RA、MCTD |
| 肺胞出血 | MPA、GPA | |
| 肺高血圧 | 強皮症、MCTD | |
| 胸膜炎 | SLE | |
| 心臓 | 心膜炎 | SLE |
| 心筋炎 | SLE、多発性筋炎 | |
| 冠動脈血栓 | APS | |
| 肺性心 | 強皮症 | |
| 腎臓 | ループス腎炎 | SLE |
| 半月体形成性腎炎 | GPA、MPA | |
| 腎クリーゼ | 全身性強皮症 | |
| 神経 | てんかん、精神症状 | SLE |
| 多発単神経炎 | ANCA関連血管炎 | |
| 脳梗塞 | APS | |
| 消化管 | 食道運動低下、逆流性食道炎 | 強皮症 |
| 腸管潰瘍 | ベーチェット病 | |
| 腸管虚血 | 血管炎 | |
| 血液 | 溶血性貧血 | SLE |
| 白血球減少 | SLE | |
| 血小板減少 | SLE、APS | |
| 血栓症 | APS | |
| 血管 | レイノー現象 | 強皮症、MCTD、SLE |
| 血管炎 | GPA、MPA、EGPA | |
| 動静脈血栓 | APS | |
| 妊娠 | 習慣流産 | APS |
| 新生児ループス、先天性房室ブロック | SLE（抗SS-A抗体陽性） |
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